Во-первых каталоги css, img и javascripts можно хранить, как svn:externals.
Во-вторых, можно записывать, что таким-то ревизиям логики соответствует такая-то ревизия дизайна. Дизайнер же меняет верстку, это надо отслеживать. Ну и работа у программиста с верстальщиком не пересекается.